Gemäß den ersten geschriebenen Dokumenten werden Apotheker als von der Kommune von Split bezahlter Beruf zum ersten Mal Ende des 13. Jahrhunderts und Anfang des 14. Jahrhunderts erwähnt. Die Apotheker wurden für die Gemeinde von der Kommune gewählt und ihnen wurde der Zusammenschluss mit allen Ärzten verboten (Das Statut der Stadt aus dem Jahr 1312)

Die Apotheken haben mit der Zeit ihre Form geändert. Die heute älteste Apotheke in Split befindet sich im Erdgeschoss des Gebäudes in der Straße Marmontova 2. Diese Apotheke hat ihre originelle Funktion, Möbeln und sonstige Ausstattung behalten. Diese wurde im Jahr 1865 vom Herrn Jovo Matačić eröffnet. Den Raum hat er im Jahr 1890 mit Möbeln aus einer italienischen Apotheke ausgestattet. Die Möbeln wurden dem Raum angepasst, über deren Originalität zeugen ornamentale Dekorationen aus der Neorenaissance und Figuren des griechischen Arztes in Rom, Galen, (Jahre 129-199.) und des Gottes der Heilkunst in der römischen Mythologie, Äskulap. Die Apotheke bleibt bis zu der Nationalisierung im Jahr 1948 in privatem Besitz.

Nach dem II. Weltkrieg gab es insgesamt 12 Apotheken in der Gemeinde von Split, alle in privatem Besitz. 9 davon waren in der Stadt Split selbst, je eine in Kaštel Sućurac, Kaštel Stari und Solin. Im Jahr 1948 wurden alle Apotheken nationalisiert und das Unternehmen mit dem Namen VOLKSAPOTHEKEN wurde gegründet. Dieses wurde im Jahr 1954 aufgelöst und 10 selbstständige Apotheken wurden gegründet.

Manche der Apotheken haben in der Zwischenzeit ihren Sitz geändert (aus der Krešimirova Straße auf den Volksplatz (Narodni trg) – im Jahr 1954, aus der Solinska in die heutige Gundulićeva Straße). Im Jahr 1962 haben sich sieben Apotheken in eine neue Einrichtung integriert, die Stadtapotheken, während die Apotheken in Solin, Kaštel Sućurac und Kaštel Stari auch weiter selbstständig bleiben, um im Jahr 1964 eine einzige Einrichtung zu werden. Die Einrichtung hat sich nach der Integrierung weiterentwickelt, und zwar durch die Gründung des galenischen Laboratoriums (1965), das Öffnen der Abteilung für Sanitätswaren und einer ganzen Reihe anderer Apotheken.

Die Stadtapotheke geht im Jahr 1993 aus dem Besitz der Gesellschaft in den Besitz der Gespannschaft Split-Dalmatien über und ändert den Namen in Apotheke Split. Als solche beschäftigt sie 126 Angestellte. Durch die Denationalisierung wird die Tätigkeit der ersten Apotheken aus der Einrichtung ungewiss , die die Grundlage für das Erweitern der Apothekenvernetzung und der kompletten Entwicklung der Einrichtung waren, da die  Verhältnisse auf dem Markt kein „Ohr“ für die Gesundheitstätigkeit und somit auch die Pharmazie als eine der ältesten Tätigkeiten in dieser Stadt haben.

Der Apotheke Split wurden seit dem 01.01.2004 mit dem Beschluss der Gespannschaftsbehörde der Gespannschaft Split-Dalmatien die Apotheken aus dem medizinischen Versorgungszentrum der Gespannschaft Split-Dalmatien (sieben Apotheken und Depos) angeschlossen, die nicht den dort angestellten Magistern der Pharmazie vermietet wurden.

Anfang 2004 wurden mit dem Beschluss desselben Organs die Einrichtungen „Apotheke Makarska“, „Apotheke Sinj“ und „Apotheke Split“ in eine einzigartige Einrichtung mit dem Namen „Apotheke der Gespannschaft Split-Dalmatien“zusammengeschlossen. Die Einrichtung führt so ihre Tätigkeit über 30 Apotheken, 3 Medikamenten-Depos und 2 Laboratoriums (das galenische Laboratorium und das Laboratorium für die Qualitätsprüfung der galenischen Präparate) durch.